Tableau d'interprétation
Mockup
Un tableau dynamique avait été créé pour faire aux utilisateurs une présentation dynamique des fonctionnalités de base prévues pour le tableau.
Attention
Cette version fonctionne sans back. Certaines actions montrées n'ont pas lieu d'être manuelles dans le cadre de l'application.
Composants
Cet écran est constitué de plusieurs composants principaux :
Menu de filtrage
???+ abstract "TL;DR" === "En résumé" Un menu latéral pour filtrer les variations affichées dans le tableau
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- Afficher les variations flag par l'utilisateur : "variations d'intérêt", "variations à étudier", "variations non pertinentes", autres tags manuels ou automatiques.
- Appliquer des filtres rapides : permet d'ajouter un filtre temporaire au nœud du graphe actuellement actif (e.g. de novo, exonic, frameshift, AF < 0.001,...).
- Ajouter des nœuds : permet d'ajouter un nœud à une branche du graphe pour y ajouter une étape de filtrage ou des annotations. Si un nouveau filtre appliqué dépend d'une annotation absente, il sera automatiquement précédé par l'étape d'annotation adéquate. Un filtre complexe offre des options avancées comme l'ajout automatique d'un tag aux variations passant le nœud.
- Appliquer un filtrage enregistré : liste de filtrages enregistrés par l'utilisateur à appliquer à la place ou en complément du graphe actuellement utilisé.
- Peut être masqué pour libérer de la largeur à l'écran.
Visualisation du graphe
???+ abstract "TL;DR" === "En résumé" Une réprésentation graphique des étapes de filtrage appliquées
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Note
Ce composant est d'une priorité faible et non nécessaire pour un MVP
- Cadre permettant une représentation graphique du filtrage appliqué à l'analyse. Chaque
nœud le composant correspond à une étape d'annotation ou à un filtre complexe.
Dans le cas d'un filtre, le nœud affiche le nom du filtre complexe si précisé, le nombre de variations passant ses critères et les tags appliqués automatiquement le cas échéant. - Survoler un nœud affichera un détail des filtres ou annotations appliquées.
- Sélectionner un nœud affichera dans le tableau d'interprétation les variations passant ledit nœud.
- Il est possible de modifier les valeurs appliquées aux différents nœuds ; la confirmation de ces modifications entraînera un recalcul.
- Peut être masqué pour libérer de la hauteur à l'écran.
Tableau d'interprétation
???+ abstract "TL;DR" === "En résumé" Macro-composant contenant le tableau listant les variations et permettant à l'utilisateur d'agir dessus (catégorisation, commentaire…)
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La tableau d'interprétation où seront affichées les données incluses dans l'analyse. Composé de :
- Des onglets permettent d'alterner entre les différents types de données analysées (e.g. SNV, CNV, ADN mitochondrial...).
- Une barre d'outils permettant :
- flag une variation "d'intérêt" ou "non pertinentes"
- ajouter une note pense-bête
- ajouter un tag
- rechercher dans le tableau
- réinitialiser l'affichage du tableau
- personnaliser les colonnes affichées et la pagination
- exporter les données
- Les colonnes du tableau sont redimensionnables et réorganisables. Leurs entêtes
permettent de modifier l'affichage des variations dans le tableau (e.g. trier par
classes ACMG décroissantes, nom du gène contient "BRC",...).
Des colonnes peuvent être verrouillées au choix de l'utilisateur pour être toujours visibles à l'écran lorsque celui-ci fait défiler le tableau horizontalement. - Les lignes du tableau commencent par une checkbox permettant de faire une sélection
multiple de variations.
Leur contenu dépendra du type de données et des annotations appliquées par l'utilisateur.
Elles se terminent par un bouton à droite, toujours visible, qui, lorsque survolé, permet d'afficher dans une infobulle le contenu des colonnes hors cadre à droite.
Lorsqu'une variation est sélectionnée, un accordéon se déplie pour afficher la liste des transcrits concernés.
Last update:
October 4, 2023